建於西元1684年，主祀玄天上帝，其歷史演變與在地早期鹽田文化息息相關，300多年來護佑在地以務農及曬鹽維生的鄉民們，為在地人的精神信仰寄託。早期鹽埕人將曬好的鹽從北極殿附近的「泮港」運往安平等處，現雖已不見河港痕跡，仍可從廟宇附近錯綜複雜的街道一窺端倪。北極殿每12年一次的大建醮遶境路線，也大致上與古地圖中河道相同，由此更能看出其曬鹽歷史的關聯性。從在地信仰中找出鹽埕舊港的歷史脈絡，更呼應著「北港媽祖，南港上帝公」的形容。